柯基的蓝眼睛遗传吗？
首先，要搞清楚什么是“蓝眼”。 很多种狗是有“蓝眼”这个颜色的，比如苏格兰牧羊犬、边牧，还有国内非常热门的柴犬，都是有一蓝一褐或者一蓝一黑的瞳孔颜色。 但是，这些狗狗都不是柯基！ 虽然它们长相很相似，而且都很聪明。
柯基的蓝眼睛（青眼）是独有的特征。 也就是说，一只柯基，要么双眼一蓝一黑或者一蓝一褐，要么就是两只眼睛全黑。不存在第三只眼其它颜色的可能。 而决定眼睛颜色的基因，在犬类中属于隐性基因。也就是说，这只犬拥有两个蓝眼的基因，并且恰好这两个基因在一个染色体上，才会表现出蓝色眼睛。 如果这只犬仅有一个蓝眼的基因，而另一个基因是褐色的，那么它就会有一只褐色的眼睛；如果只有黑色一个颜色基因，那它就有黑色的眼睛。而两只眼睛的颜色是一样的。
一只纯种的柯基，其后代的眼睛颜色应该是一一对应且固定的。蓝色和褐色眼睛的概率各一半。 而杂种的柯基，因为染色体的缘故，眼睛的颜色可能是多变的，也可能出现斜眼、斗鸡眼等情况。 而题主说的“两边眼睛不一样大”“一边眼睛内陷”的情况，一般出现在杂种的柯基幼犬身上，随着成长逐渐会改善。当然，也有例外。
不过，就算是一只纯种的柯基，如果饲养不当，缺乏微量元素，造成异食癖，也会使眼球变型，出现偏头、歪脑等现象。 当然，这一切都需要专业的动物眼科医生诊断之后，才能确定原因。